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关于马在更新世末期在北美灭绝的原因和方式，人们一直存在猜测。冰川融化可能是其中的一个原因。我们最容易联想到马的是什么？当然是自由，也就是在群体中奔跑的自由，不受围栏的限制，也不受边界的限制。
因此，正如所有生命形式一样，同样的理念也体现在那个“马之国”的土著人民观念中，也就不足为奇了。拉科塔人(Lakotas)是苏族里的一个美洲原住民部落 ，他们认为：认生命不仅始终处于运动之中，而且是相互依存的。这一名为“yutaŋ’kil”的生物学概念，与基因组学 和同位素分析一起，成为登上2025年5月15日《科学》杂志封面的 一项研究基础。
为了追踪过去 5 万年中，马匹如何应对，以冰川期和随后的解冻期为标志的环境变化，由图卢兹人类生物学和基因组学中心领导的研究小组得出了结论：在更新世纪时期，马匹曾多次通过白令海的陆桥在美洲和欧亚大陆之间迁徙。
由于全球暖化导致美洲大陆北部的马匹数量减少，这些迁徙活动也随之结束。
人类如何改造马的基因组，使其成为自己的坐骑呢？
一项研究揭示了与5000多年前马的驯化过程有关的基因逐渐变化。
另外，根据中法遗传学家合作开展，并发表在《科学》杂志上，针对一匹坐骑用途马匹的研究，这匹马被特意培育为坐骑，这一点在其基因组中得到了证实。
通过比对古代马匹骨骼的基因组，我们已确定了现代马的起源地，是在里海以北的中亚草原。此外，比对还揭示了与驯化马匹相关的渐进式基因改造，这种改造始于5000多年前，远远晚于其他家畜的驯化年代。
在此之前，这种动物一直被当作人类食品肉和奶的来源，马匹首先要经过选择，以保留那些不那么胆小、更温顺的马匹个体，即与一种叫ZFPM1蛋白，锌指蛋白多形性相关的第一个基因变异的携带者。
几个世纪以来，另一种与GSDMC蛋白质减少现象相关的基因变异一直受到饲养者的青睐，因为它可以让具备这种变异的马匹 拥有更强健的马后躯、更发达的前腿和更好的运动协调性。
当研究人员减少小老鼠体内的这种 GSDMC 蛋白质的产量时，这些新特性在小鼠身上得到了证实。由此产生的马匹，能够更好地支撑骑士们的负重，并进行长距离的奔跑，使其成为近四千年来人类强大的运输工具，和作战征服的工具。
所有现代马匹都是经过人类选择的那些马匹个体的后代
大约公元前 900 年，人类的选择进一步使马的基因组倾向于体型更大的个体，根据研究作者的说法，这与第一批骑兵的时间出现相吻合。
后来，白色和棕色毛色的变异出现在马种群中，这同样受到了经过人类选择的影响。所有现存的马都起源于最初被人类根据其载重能力而挑选出来的个体，这些个体最终取代了曾经在地球上繁衍生息的史前的马种群。
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